Il laboratorio di scienze è formato da due locali dedicati rispettivamente alle esperienze di chimica o alle osservazioni di biologia. Molto ampio e luminoso, il laboratorio di chimica è organizzato in isole di lavoro con banconi dotati di becchi bunsen, rubinetti e prese elettriche per permettere la realizzazione di diverse esperienze; anche il reagentario è piuttosto ricco e diversificato; adeguata all'esigenza di un lavoro a piccoli gruppi la vetreria; non mancano, ovviamente le cappe e le strutture deputate alla sicurezza. Sono invece in dotazione del laboratorio di biologia molti microscopi luce monooculari ed alcuni microscopi stereo, per permettere l'osservazione sia di sezioni sottili, sia di preparati tridimensionali. Dall'anno scorso si possono svolgere delle osservazioni al microscopio con tutta la classe grazie ad un collegamento ad un video che permette di riconoscere insieme i preparati. Per lo studio delle scienze della Terra è disponibile una ricca collezione di campioni di minerali e di rocce correttamente catalogati e classificati. Esiste anche una strumento per lo studio dei moti relativi di Sole, Terra e Luna. L'aiuto di personale tecnico qualificato permette di svolgere un buon numero di esperienze in modo corretto e sicuro.
